69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5450 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  89.59 
 
 		 672 bp  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5450    100 
 
 		 789 bp  1564    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5483  putative integrase  90.21 
 
 		 468 bp  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.704423 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5640    98.73 
 
 		 246 bp  297  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4230    83.01 
 
 		 436 bp  212  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.384542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    82.78 
 
 		 2455 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  82.78 
 
 		 1118 bp  111  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    88.17 
 
 		 860 bp  97.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0465    88.04 
 
 		 926 bp  95.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  86.02 
 
 		 855 bp  81.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1903    89.71 
 
 		 183 bp  79.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1902    89.71 
 
 		 363 bp  79.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  86.21 
 
 		 417 bp  77.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  86.21 
 
 		 825 bp  77.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  87.84 
 
 		 930 bp  75.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  87.84 
 
 		 930 bp  75.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  87.84 
 
 		 930 bp  75.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  92.45 
 
 		 930 bp  73.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  86.42 
 
 		 930 bp  73.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  92.45 
 
 		 924 bp  73.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  86.42 
 
 		 930 bp  73.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  86.42 
 
 		 930 bp  73.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  85.54 
 
 		 930 bp  69.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4170    88.06 
 
 		 216 bp  69.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292465  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7887    85.9 
 
 		 637 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5058    85.37 
 
 		 585 bp  67.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  85.19 
 
 		 873 bp  65.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  83.87 
 
 		 546 bp  65.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  86.11 
 
 		 921 bp  63.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2460  transposase IS3/IS911 family protein  85 
 
 		 897 bp  63.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  85 
 
 		 783 bp  63.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  88.14 
 
 		 570 bp  61.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  84.81 
 
 		 351 bp  61.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  90.2 
 
 		 873 bp  61.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  90.2 
 
 		 873 bp  61.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  90.2 
 
 		 873 bp  61.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  90.2 
 
 		 873 bp  61.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  84.15 
 
 		 930 bp  60  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    84.15 
 
 		 1992 bp  60  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  84.15 
 
 		 930 bp  60  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  84.15 
 
 		 930 bp  60  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1661  integrase catalytic region  91.3 
 
 		 447 bp  60  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  83.13 
 
 		 939 bp  54  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  82.93 
 
 		 1128 bp  52  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1816    89.13 
 
 		 291 bp  52  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.787707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  79.11 
 
 		 795 bp  52  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5765    93.94 
 
 		 411 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  normal  0.53939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3888    100 
 
 		 955 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3869    100 
 
 		 982 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2762    90.24 
 
 		 852 bp  50.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.629665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 708 bp  50.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  84.06 
 
 		 702 bp  50.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  100 
 
 		 1212 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 846 bp  48.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  100 
 
 		 1212 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>