13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3787 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3787    100 
 
 		 351 bp  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283893  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    82.66 
 
 		 1215 bp  151  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3302    89.6 
 
 		 210 bp  141  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  86.92 
 
 		 1251 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    86.92 
 
 		 2455 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  86.92 
 
 		 1251 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    86.92 
 
 		 2420 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  86.92 
 
 		 1251 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  86.92 
 
 		 1251 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  86.92 
 
 		 1251 bp  101  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  83.52 
 
 		 1206 bp  61.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    83.33 
 
 		 1188 bp  56  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    87.04 
 
 		 367 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>