17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0279 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0279    100 
 
 		 1215 bp  2409    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3787    82.66 
 
 		 351 bp  151  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  80.68 
 
 		 1206 bp  119  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  82.63 
 
 		 1209 bp  101  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    81.18 
 
 		 1188 bp  91.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  84.96 
 
 		 1254 bp  89.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  81.88 
 
 		 1251 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  81.88 
 
 		 1251 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  81.88 
 
 		 1251 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    81.88 
 
 		 2420 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  81.88 
 
 		 1251 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    81.88 
 
 		 2455 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  81.88 
 
 		 1251 bp  87.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    88.41 
 
 		 367 bp  73.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    92.31 
 
 		 759 bp  71.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    86.3 
 
 		 555 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0831    86.3 
 
 		 258 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>