18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3063 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3063    100 
 
 		 759 bp  1505    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1110    82.31 
 
 		 1529 bp  333  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  80.48 
 
 		 1533 bp  216  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  83.96 
 
 		 1518 bp  133  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  83.96 
 
 		 1518 bp  133  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  83.96 
 
 		 1518 bp  133  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1211    80.18 
 
 		 1521 bp  129  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3059    83.77 
 
 		 1131 bp  107  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1002    79.53 
 
 		 795 bp  77.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    92.31 
 
 		 1215 bp  71.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6757    85.9 
 
 		 255 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384736  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  93.02 
 
 		 1206 bp  61.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  82.18 
 
 		 1590 bp  58  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    92.5 
 
 		 1188 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3009    92.11 
 
 		 354 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2932    90.48 
 
 		 468 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0821023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  92.11 
 
 		 1386 bp  52  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  93.75 
 
 		 1209 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>