32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1110 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1110    100 
 
 		 1529 bp  3031    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3059    84.93 
 
 		 1131 bp  468  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  79.46 
 
 		 1533 bp  394  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    82.31 
 
 		 759 bp  333  9e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  84.04 
 
 		 1518 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  84.04 
 
 		 1518 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  84.04 
 
 		 1518 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1211    82.87 
 
 		 1521 bp  248  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4053  hypothetical protein  85.28 
 
 		 405 bp  244  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1002    83.74 
 
 		 795 bp  141  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2932    82.58 
 
 		 468 bp  93.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0821023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1474    84.62 
 
 		 342 bp  79.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6757    81.43 
 
 		 255 bp  71.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384736  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4650    82.86 
 
 		 1579 bp  65.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4303    81.2 
 
 		 177 bp  65.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  84.34 
 
 		 1614 bp  61.9  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  91.3 
 
 		 1476 bp  60  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  89.8 
 
 		 1593 bp  58  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0941    84.51 
 
 		 1055 bp  54  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  96.67 
 
 		 1572 bp  52  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  81.63 
 
 		 1590 bp  52  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 		 1065 bp  52  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 1098 bp  52  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 1065 bp  52  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 1065 bp  52  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  96.67 
 
 		 1572 bp  52  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4961    84.42 
 
 		 306 bp  50.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.839822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  88.89 
 
 		 432 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  84.62 
 
 		 1026 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  96.55 
 
 		 4545 bp  50.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  93.75 
 
 		 1386 bp  48.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 1428 bp  48.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.131281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>