16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3059 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3059    100 
 
 		 1131 bp  2242    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1110    84.93 
 
 		 1529 bp  468  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  79.89 
 
 		 1533 bp  147  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    83.77 
 
 		 759 bp  107  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  79.18 
 
 		 1518 bp  97.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  79.18 
 
 		 1518 bp  97.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1211    81.03 
 
 		 1521 bp  93.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  78.84 
 
 		 1518 bp  89.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2874    83.33 
 
 		 1016 bp  56  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261826  normal  0.097333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  79.72 
 
 		 1590 bp  54  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  88 
 
 		 1593 bp  52  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6199  transposase IS66  88 
 
 		 1650 bp  52  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.07824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4303    82.72 
 
 		 177 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  96.55 
 
 		 4545 bp  50.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  85.71 
 
 		 1563 bp  48.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  85.71 
 
 		 1563 bp  48.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>