12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2874 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2874    100 
 
 		 1016 bp  2014    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261826  normal  0.097333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  81.82 
 
 		 1590 bp  283  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4650    79.27 
 
 		 1579 bp  280  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  83.73 
 
 		 1614 bp  196  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1211    86.89 
 
 		 1521 bp  58  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3059    83.33 
 
 		 1131 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  100 
 
 		 1527 bp  54  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  100 
 
 		 1422 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  100 
 
 		 1422 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  85.96 
 
 		 1518 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  85.96 
 
 		 1518 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  85.96 
 
 		 1518 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>