22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1211 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1211    100 
 
 		 1521 bp  3015    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  80.26 
 
 		 1518 bp  557  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  80.26 
 
 		 1518 bp  557  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  80.19 
 
 		 1518 bp  549  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1110    82.87 
 
 		 1529 bp  248  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1474    92.26 
 
 		 342 bp  230  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1002    80.46 
 
 		 795 bp  228  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  78.84 
 
 		 1533 bp  141  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2932    84.24 
 
 		 468 bp  135  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0821023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    80.18 
 
 		 759 bp  129  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3059    81.03 
 
 		 1131 bp  93.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6757    80.89 
 
 		 255 bp  73.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384736  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  86.96 
 
 		 1476 bp  65.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  91.49 
 
 		 1590 bp  61.9  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2874    86.89 
 
 		 1016 bp  58  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261826  normal  0.097333 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  92.68 
 
 		 1593 bp  58  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 4875 bp  54  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4303    88.89 
 
 		 177 bp  50.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  96.55 
 
 		 1527 bp  50.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  90 
 
 		 1584 bp  48.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 648 bp  48.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4650    90 
 
 		 1579 bp  48.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>