16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1002 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1002    100 
 
 		 795 bp  1576    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  81 
 
 		 1518 bp  254  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  81 
 
 		 1518 bp  254  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  81 
 
 		 1518 bp  254  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1211    80.46 
 
 		 1521 bp  228  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2932    86.78 
 
 		 468 bp  163  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0821023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4303    86.55 
 
 		 177 bp  157  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6757    92.11 
 
 		 255 bp  155  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384736  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1110    83.74 
 
 		 1529 bp  141  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  86.26 
 
 		 1533 bp  117  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    79.53 
 
 		 759 bp  77.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  88.68 
 
 		 1662 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  88.68 
 
 		 1662 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  88.68 
 
 		 1620 bp  58  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0779  hypothetical protein  100 
 
 		 570 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0000607574  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  94.29 
 
 		 1386 bp  54  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>