11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4650 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0693  transposase  86.42 
 
 		 1614 bp  1298    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4650    100 
 
 		 1579 bp  3130    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  87.36 
 
 		 1590 bp  1497    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2874    79.27 
 
 		 1016 bp  280  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261826  normal  0.097333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  80.86 
 
 		 1533 bp  75.8  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1110    82.86 
 
 		 1529 bp  65.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  91.11 
 
 		 1593 bp  58  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  96.67 
 
 		 1527 bp  52  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2932    83.12 
 
 		 468 bp  50.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0821023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1211    90 
 
 		 1521 bp  48.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  100 
 
 		 1476 bp  48.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>