19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3009 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3009    100 
 
 		 354 bp  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4182  transposase IS66  88.85 
 
 		 1002 bp  280  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445979  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3008    100 
 
 		 246 bp  258  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3507    93.57 
 
 		 156 bp  206  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664173  normal  0.703006 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3010    100 
 
 		 1167 bp  151  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  94.2 
 
 		 828 bp  105  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  90.48 
 
 		 1620 bp  77.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  88.89 
 
 		 1545 bp  69.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  86.96 
 
 		 330 bp  65.9  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  87.3 
 
 		 1662 bp  61.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  87.3 
 
 		 1662 bp  61.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1563 bp  56  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1563 bp  56  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    92.11 
 
 		 759 bp  52  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  89.13 
 
 		 1533 bp  52  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  100 
 
 		 1203 bp  46.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  88.37 
 
 		 1386 bp  46.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  89.74 
 
 		 1026 bp  46.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 1155 bp  46.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>