9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3008 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3008    100 
 
 		 246 bp  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3009    100 
 
 		 354 bp  258  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  90.27 
 
 		 828 bp  208  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  85.95 
 
 		 330 bp  145  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4183    95.16 
 
 		 147 bp  99.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300351  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4182  transposase IS66  92.42 
 
 		 1002 bp  83.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445979  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  89.83 
 
 		 1620 bp  69.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  86.15 
 
 		 1662 bp  58  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  86.15 
 
 		 1662 bp  58  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>