36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3010 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3010    100 
 
 		 1167 bp  2313    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4181  hypothetical protein  92.59 
 
 		 300 bp  414  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4182  transposase IS66  89.11 
 
 		 1002 bp  383  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  92.92 
 
 		 357 bp  321  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  93.41 
 
 		 189 bp  266  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  79.54 
 
 		 1620 bp  256  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  79.27 
 
 		 1545 bp  240  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4180    89.71 
 
 		 177 bp  204  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  84.68 
 
 		 354 bp  190  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1959    84.4 
 
 		 336 bp  186  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0610    83.2 
 
 		 397 bp  163  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3507    97.73 
 
 		 156 bp  159  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664173  normal  0.703006 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3009    100 
 
 		 354 bp  151  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4179    90.35 
 
 		 120 bp  139  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  79.37 
 
 		 1662 bp  133  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  79.37 
 
 		 1662 bp  133  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  81.88 
 
 		 354 bp  81.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  90.62 
 
 		 1584 bp  79.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  93.33 
 
 		 1542 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  93.33 
 
 		 1572 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1809  transposase IS66  93.33 
 
 		 972 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  83.33 
 
 		 354 bp  56  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1210    86.44 
 
 		 311 bp  54  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  81.63 
 
 		 354 bp  52  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  81.63 
 
 		 354 bp  52  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  93.94 
 
 		 1026 bp  50.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  96.55 
 
 		 357 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>