More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4182 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4182  transposase IS66  100 
 
 		 333 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445979  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  73.13 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  72.02 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  69.25 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  69.25 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  54.02 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  46.67 
 
 		 529 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  45.83 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  70.4 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  44.17 
 
 		 510 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  43.32 
 
 		 505 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  43.32 
 
 		 505 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  43.32 
 
 		 505 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  44.2 
 
 		 523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  43.94 
 
 		 523 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  44.2 
 
 		 513 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  43.64 
 
 		 461 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  57.62 
 
 		 341 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  38.96 
 
 		 520 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  38.96 
 
 		 520 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  39.56 
 
 		 530 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2726  transposase IS66  38.81 
 
 		 516 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6199  transposase IS66  39.08 
 
 		 549 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.07824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  37.5 
 
 		 524 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  37.5 
 
 		 524 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  36.41 
 
 		 524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  36.14 
 
 		 524 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  37.85 
 
 		 520 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  36.16 
 
 		 508 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  36.44 
 
 		 523 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  36.44 
 
 		 523 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  36.44 
 
 		 523 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  36.44 
 
 		 523 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  36.44 
 
 		 523 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  36.44 
 
 		 523 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  36.16 
 
 		 523 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  35.47 
 
 		 556 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  35.69 
 
 		 532 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  35.88 
 
 		 531 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  35.79 
 
 		 562 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  34.08 
 
 		 535 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  35.85 
 
 		 522 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  32.78 
 
 		 523 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  32.23 
 
 		 524 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  35.85 
 
 		 553 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  32.78 
 
 		 523 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  32.23 
 
 		 523 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  32.23 
 
 		 523 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  32.23 
 
 		 523 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  32.23 
 
 		 523 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  32.23 
 
 		 523 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  32.23 
 
 		 523 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  35.26 
 
 		 545 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  35.26 
 
 		 545 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  35.26 
 
 		 545 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  35.26 
 
 		 545 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1809  transposase IS66  55.62 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  34.99 
 
 		 545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  34.71 
 
 		 545 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  34.84 
 
 		 491 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  32.86 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>