18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6341 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6341    100 
 
 
367 bp  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    89.46 
 
 
555 bp  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0831    91.27 
 
 
258 bp  325  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  85.59 
 
 
1254 bp  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0162    89.52 
 
 
557 bp  274  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2712    87.59 
 
 
239 bp  129  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  87.06 
 
 
1206 bp  81.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    87.06 
 
 
1188 bp  81.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    88.41 
 
 
1215 bp  73.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  82.61 
 
 
1209 bp  69.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  90.74 
 
 
1251 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  90.74 
 
 
1251 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  90.74 
 
 
1251 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    90.74 
 
 
2420 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  90.74 
 
 
1251 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    90.74 
 
 
2455 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  90.74 
 
 
1251 bp  67.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3787    87.04 
 
 
351 bp  52  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>