56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1737 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2480    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2480    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2286  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  89.21 
 
 		 1005 bp  668    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2480    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2480    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    100 
 
 		 2420 bp  4797    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  100 
 
 		 1251 bp  2480    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    100 
 
 		 2455 bp  2008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  100 
 
 		 618 bp  143  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 489 bp  125  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.290459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  79.93 
 
 		 1209 bp  111  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3698  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  89.01 
 
 		 1125 bp  101  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3787    86.92 
 
 		 351 bp  101  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1980  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  83.54 
 
 		 1662 bp  91.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    81.88 
 
 		 1215 bp  87.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1612  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  82.96 
 
 		 1056 bp  85.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0787  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  83.74 
 
 		 1056 bp  85.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0913019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5839  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  91.04 
 
 		 1008 bp  85.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3923  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  89.04 
 
 		 1050 bp  81.8  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.915341  normal  0.210379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3638  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  87.67 
 
 		 1050 bp  73.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3930  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  87.67 
 
 		 1050 bp  73.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.772102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1186  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  82.91 
 
 		 1050 bp  73.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0898  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  88.24 
 
 		 969 bp  71.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0982455  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2040  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  84.78 
 
 		 993 bp  71.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3318  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  82.35 
 
 		 1014 bp  69.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300586  normal  0.233841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0750  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  82.11 
 
 		 1056 bp  69.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0846  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  81.48 
 
 		 1014 bp  69.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    90.74 
 
 		 367 bp  67.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0432  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  87.88 
 
 		 1035 bp  67.9  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.289235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2630  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  86.49 
 
 		 978 bp  67.9  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  86.96 
 
 		 1254 bp  65.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2617    83.51 
 
 		 396 bp  65.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    93.18 
 
 		 555 bp  63.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1222  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  85.53 
 
 		 1023 bp  63.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.372035  normal  0.301451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0553  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  85.92 
 
 		 1116 bp  61.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2970  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  85.92 
 
 		 1005 bp  61.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    85.71 
 
 		 1188 bp  60  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  85.71 
 
 		 1206 bp  60  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3936  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  88.89 
 
 		 1038 bp  60  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1538  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  88.89 
 
 		 1041 bp  60  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0819  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  92.5 
 
 		 1104 bp  56  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2309  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  83.75 
 
 		 1020 bp  56  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.052492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5101  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  81.73 
 
 		 1014 bp  56  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0831    90.91 
 
 		 258 bp  56  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0692  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase 2  90.7 
 
 		 981 bp  54  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2581    85.07 
 
 		 502 bp  54  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4642  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  94.29 
 
 		 1026 bp  54  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014386  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2834  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  85.71 
 
 		 1053 bp  54  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.154537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0088  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  84.51 
 
 		 1005 bp  54  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00976639  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 2787 bp  52  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.792681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4553  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  88 
 
 		 1011 bp  52  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4777  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0409  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  84.85 
 
 		 996 bp  52  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1548  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  81.63 
 
 		 969 bp  52  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0408  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  92.11 
 
 		 1017 bp  52  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2904  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  82.02 
 
 		 969 bp  50.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2339  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA  93.94 
 
 		 987 bp  50.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.363936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>