13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2617 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2617    100 
 
 		 396 bp  785    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2581    86.9 
 
 		 502 bp  79.8  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  83.51 
 
 		 1251 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    83.51 
 
 		 2455 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  83.51 
 
 		 1251 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    83.51 
 
 		 2420 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  83.51 
 
 		 1251 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  83.51 
 
 		 1251 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  83.51 
 
 		 1251 bp  65.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  93.02 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  85.71 
 
 		 1254 bp  60  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  81.44 
 
 		 1206 bp  50.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    81.25 
 
 		 1188 bp  48.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>