17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8497 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8497    100 
 
 
555 bp  1100    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0162    89.74 
 
 
557 bp  539  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    89.46 
 
 
367 bp  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0831    94.05 
 
 
258 bp  381  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  84.2 
 
 
1254 bp  337  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2712    84.46 
 
 
239 bp  103  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  90.36 
 
 
1206 bp  101  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    90.36 
 
 
1188 bp  101  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  81.48 
 
 
1209 bp  69.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    86.3 
 
 
1215 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  93.18 
 
 
1251 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  93.18 
 
 
1251 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  93.18 
 
 
1251 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    93.18 
 
 
2420 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  93.18 
 
 
1251 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    93.18 
 
 
2455 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  93.18 
 
 
1251 bp  63.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>