53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4170 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4170    100 
 
 		 216 bp  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  84.16 
 
 		 795 bp  139  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  88.5 
 
 		 822 bp  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  88.5 
 
 		 822 bp  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  88.5 
 
 		 822 bp  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  88.5 
 
 		 822 bp  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  88.5 
 
 		 822 bp  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 855 bp  71.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    88.24 
 
 		 860 bp  71.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2459  hypothetical protein  93.75 
 
 		 270 bp  71.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    88.06 
 
 		 2455 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  93.62 
 
 		 873 bp  69.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  88.06 
 
 		 1118 bp  69.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5450    88.06 
 
 		 789 bp  69.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5640    87.69 
 
 		 246 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  93.18 
 
 		 702 bp  63.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  97.06 
 
 		 783 bp  60  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  89.58 
 
 		 546 bp  56  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  86.67 
 
 		 672 bp  56  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7887    90.91 
 
 		 637 bp  56  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  85.29 
 
 		 714 bp  56  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  85.29 
 
 		 714 bp  56  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  85.29 
 
 		 714 bp  56  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  85.29 
 
 		 714 bp  56  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  86.44 
 
 		 930 bp  54  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  89.36 
 
 		 873 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  89.36 
 
 		 873 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  89.36 
 
 		 873 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  89.36 
 
 		 873 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    89.13 
 
 		 1092 bp  52  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  89.13 
 
 		 930 bp  52  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  89.13 
 
 		 930 bp  52  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  89.13 
 
 		 930 bp  52  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  94.12 
 
 		 474 bp  52  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  90 
 
 		 930 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  88.64 
 
 		 921 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 897 bp  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  85.71 
 
 		 318 bp  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02902    91.67 
 
 		 786 bp  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  91.67 
 
 		 846 bp  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  90 
 
 		 924 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  88.37 
 
 		 708 bp  46.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  87.23 
 
 		 939 bp  46.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  87.23 
 
 		 570 bp  46.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>