47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1497 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1497    100 
 
 		 2972 bp  5892    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 873 bp  101  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1902    88.76 
 
 		 363 bp  97.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    88.12 
 
 		 1092 bp  97.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  81.91 
 
 		 546 bp  95.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  86.41 
 
 		 930 bp  93.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  86.41 
 
 		 924 bp  93.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1903    88.37 
 
 		 183 bp  91.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  89.19 
 
 		 930 bp  83.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  89.19 
 
 		 930 bp  83.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  89.19 
 
 		 930 bp  83.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  81.41 
 
 		 702 bp  79.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    89.39 
 
 		 691 bp  75.8  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  85.42 
 
 		 939 bp  71.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0520    87.5 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0465    85.87 
 
 		 926 bp  71.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0516    87.5 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3888    92.31 
 
 		 955 bp  71.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3869    92.31 
 
 		 982 bp  71.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 873 bp  69.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  92.16 
 
 		 873 bp  69.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    87.14 
 
 		 2455 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  87.14 
 
 		 1118 bp  67.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3393    86.11 
 
 		 304 bp  63.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  88.33 
 
 		 873 bp  63.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  88.33 
 
 		 873 bp  63.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2593    88.14 
 
 		 315 bp  61.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.790603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1904    86.15 
 
 		 396 bp  58  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 897 bp  54  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    82.83 
 
 		 860 bp  54  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 783 bp  52  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 783 bp  52  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  82.65 
 
 		 1182 bp  52  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 894 bp  50.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  86.89 
 
 		 810 bp  50.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  84.06 
 
 		 855 bp  50.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0861    87.76 
 
 		 814 bp  50.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0844    87.76 
 
 		 626 bp  50.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>