More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2504 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.28 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.13 
 
 
333 aa  325  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.24 
 
 
330 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.3 
 
 
588 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.52 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.63 
 
 
331 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.57 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.58 
 
 
328 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.66 
 
 
330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
334 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
328 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  43.08 
 
 
328 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.46 
 
 
326 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
326 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  43.48 
 
 
327 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.22 
 
 
328 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  43.69 
 
 
326 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.9 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.83 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.03 
 
 
329 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 
331 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
326 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  45.26 
 
 
326 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.69 
 
 
328 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.46 
 
 
326 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  42.46 
 
 
326 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.44 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.9 
 
 
335 aa  258  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  45.2 
 
 
331 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  43.03 
 
 
330 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
326 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.21 
 
 
325 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.94 
 
 
334 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
328 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 
326 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.51 
 
 
336 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
336 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  41.46 
 
 
332 aa  255  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.46 
 
 
332 aa  255  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  42.42 
 
 
330 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.15 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  41.34 
 
 
348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.14 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  42.46 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  41.34 
 
 
348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.11 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  42.64 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 
334 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  42.59 
 
 
324 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.14 
 
 
330 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  42.81 
 
 
328 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
326 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  42.59 
 
 
324 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  42.59 
 
 
324 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.28 
 
 
325 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  42.28 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.13 
 
 
325 aa  252  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
324 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.55 
 
 
332 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  42.28 
 
 
324 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
324 aa  252  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  41.98 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  40.31 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.65 
 
 
335 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
326 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  42.28 
 
 
324 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.98 
 
 
324 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.98 
 
 
324 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  43.96 
 
 
332 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 
334 aa  250  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.17 
 
 
327 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.2 
 
 
328 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  41.36 
 
 
325 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  41.36 
 
 
325 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  41.98 
 
 
324 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  40.24 
 
 
332 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.65 
 
 
327 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  41.67 
 
 
324 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  41.67 
 
 
324 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
328 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  41.67 
 
 
324 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.94 
 
 
332 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
353 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
328 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  43.79 
 
 
327 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.24 
 
 
332 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.85 
 
 
334 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.55 
 
 
332 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  41.36 
 
 
325 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.97 
 
 
327 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.05 
 
 
326 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.44 
 
 
336 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.24 
 
 
332 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  43.47 
 
 
332 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>