65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1348 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1348  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  205  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  83.33 
 
 
368 aa  94.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  83.64 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  83.64 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1733  hypothetical protein  86.27 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  92.31 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  71.43 
 
 
382 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  71.43 
 
 
373 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  51.22 
 
 
290 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  56 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  68.57 
 
 
634 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4310  hypothetical protein  49.23 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.27811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3970  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  71.88 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  66.67 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  53.85 
 
 
294 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  65.62 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 
281 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  54 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  42 
 
 
289 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  46.27 
 
 
1083 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  42 
 
 
289 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  42 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  52.94 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.97 
 
 
312 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  66.67 
 
 
383 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  73.33 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  50.85 
 
 
256 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  69.7 
 
 
297 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  70.97 
 
 
383 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  67.5 
 
 
260 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  70 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  46.67 
 
 
311 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
766 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  65.62 
 
 
814 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  50 
 
 
285 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  55.32 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  67.74 
 
 
952 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  61.11 
 
 
2200 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  67.74 
 
 
387 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  85.19 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  55.32 
 
 
382 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  54.17 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  63.64 
 
 
940 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  50.94 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  45.45 
 
 
325 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  61.54 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  66.67 
 
 
439 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  67.74 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  67.74 
 
 
721 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  68.97 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  54.17 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  53.19 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  66.67 
 
 
93 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  51.06 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  46.81 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  51.06 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  50 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  52.27 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
313 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  45.45 
 
 
320 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
307 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  68.75 
 
 
358 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  40.32 
 
 
305 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>