37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5464 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  60.65 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  53.45 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  45.37 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  57.6 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  57.6 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  57.6 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  41.38 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  42.2 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  43.94 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  43.94 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  44.13 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  40.65 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  40.65 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  35.62 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  45.78 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  40.57 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  37.09 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  37.06 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  35.75 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  36.62 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  39.39 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  37.19 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  41.22 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  37.06 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  39.05 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  37.72 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  40.8 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  39.77 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  39.77 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  39.77 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  31.43 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  25.64 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  34.15 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  26.98 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  30.36 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  30 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>