More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3254 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
371 aa  756    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.39 
 
 
369 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.35 
 
 
391 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.15 
 
 
361 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  50.84 
 
 
390 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.45 
 
 
382 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.53 
 
 
383 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.53 
 
 
383 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.25 
 
 
383 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.39 
 
 
383 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
383 aa  299  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.7 
 
 
383 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
383 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.66 
 
 
390 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
389 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
386 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
392 aa  285  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.71 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.61 
 
 
376 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.11 
 
 
367 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.76 
 
 
368 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.79 
 
 
376 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.44 
 
 
413 aa  277  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
427 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.45 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.27 
 
 
381 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 
367 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
414 aa  266  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.18 
 
 
374 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.01 
 
 
367 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  38.25 
 
 
394 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.52 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
370 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
368 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  41.13 
 
 
379 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 
369 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.06 
 
 
368 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
368 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.06 
 
 
368 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.02 
 
 
368 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 
370 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
346 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  39.29 
 
 
357 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.35 
 
 
344 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
360 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
356 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.06 
 
 
357 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.2 
 
 
379 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.64 
 
 
356 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.42 
 
 
353 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.13 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.23 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.23 
 
 
357 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.29 
 
 
350 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.6 
 
 
357 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
350 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.92 
 
 
370 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.74 
 
 
351 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.74 
 
 
351 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.65 
 
 
350 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.14 
 
 
351 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.74 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.14 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.14 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.35 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.28 
 
 
347 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.53 
 
 
351 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.5 
 
 
350 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.05 
 
 
379 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
379 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
379 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.59 
 
 
357 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.39 
 
 
350 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.49 
 
 
352 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
379 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 
383 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.44 
 
 
379 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.44 
 
 
379 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.85 
 
 
382 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.72 
 
 
360 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
429 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
376 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
363 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.39 
 
 
363 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 
353 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.83 
 
 
363 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.3 
 
 
359 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.44 
 
 
395 aa  199  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.24 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.24 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>