42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2673 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  59.79 
 
 		 228 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  41.62 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  42.54 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  38.41 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  41.42 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  42.51 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  41.36 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  38.07 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  37.89 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  38.12 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  37.22 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  38.1 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  37.85 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  37.85 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  36.9 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  35.56 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  36.53 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  37.13 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  34.76 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  30.9 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  29.48 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  32.21 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  32.61 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  25.68 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  28.8 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  23.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  22.01 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  26.29 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  26.29 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  21.88 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  25.29 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  28.97 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  24.42 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  25.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  24.71 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  26.63 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  27.22 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.58 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  23.84 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  23.26 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.44 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>