More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2048 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.12 
 
 
591 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.83 
 
 
591 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.4 
 
 
584 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.77 
 
 
591 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.31 
 
 
592 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.77 
 
 
591 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.38 
 
 
607 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
596 aa  1205    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.23 
 
 
584 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.04 
 
 
601 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.71 
 
 
601 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.23 
 
 
600 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.39 
 
 
575 aa  631  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.31 
 
 
592 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.6 
 
 
593 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.82 
 
 
586 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.03 
 
 
585 aa  622  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.56 
 
 
592 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.08 
 
 
585 aa  621  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.18 
 
 
592 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.47 
 
 
583 aa  618  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  51.4 
 
 
586 aa  618  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.12 
 
 
584 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.01 
 
 
588 aa  614  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.66 
 
 
581 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.59 
 
 
588 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1779  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.93 
 
 
585 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502039  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.5 
 
 
596 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.41 
 
 
588 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53 
 
 
589 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  51.06 
 
 
584 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.88 
 
 
585 aa  605  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.86 
 
 
592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.21 
 
 
592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.87 
 
 
596 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.69 
 
 
592 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  52.65 
 
 
582 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.04 
 
 
592 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.74 
 
 
567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.51 
 
 
593 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1779  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.38 
 
 
608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.11 
 
 
564 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.82 
 
 
576 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  49.12 
 
 
582 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  49.11 
 
 
564 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.04 
 
 
581 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.81 
 
 
572 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.04 
 
 
581 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.98 
 
 
573 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.89 
 
 
572 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.89 
 
 
572 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.06 
 
 
572 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.13 
 
 
570 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.71 
 
 
572 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.12 
 
 
585 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.15 
 
 
588 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.94 
 
 
573 aa  554  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.79 
 
 
566 aa  552  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.97 
 
 
572 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.36 
 
 
572 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.89 
 
 
607 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.91 
 
 
572 aa  548  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.75 
 
 
574 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.45 
 
 
573 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.42 
 
 
574 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.21 
 
 
587 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.36 
 
 
572 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  47.8 
 
 
574 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.39 
 
 
604 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.8 
 
 
574 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.8 
 
 
574 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.59 
 
 
566 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  47.8 
 
 
574 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.67 
 
 
572 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.57 
 
 
574 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.62 
 
 
587 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.98 
 
 
572 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.93 
 
 
574 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  47.32 
 
 
572 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.83 
 
 
594 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.56 
 
 
572 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.56 
 
 
572 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.8 
 
 
574 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.8 
 
 
574 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.83 
 
 
572 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.57 
 
 
572 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.89 
 
 
592 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.25 
 
 
593 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.1 
 
 
593 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.31 
 
 
584 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  46.91 
 
 
566 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.63 
 
 
574 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.65 
 
 
573 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  47.63 
 
 
568 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.3 
 
 
572 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.93 
 
 
574 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.36 
 
 
595 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.31 
 
 
584 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.29 
 
 
575 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.14 
 
 
584 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>