37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0474 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  100 
 
 		 143 aa  277  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  58.33 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  59.5 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  52.7 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  57.85 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  54.92 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  54.14 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  41.73 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  40.65 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  42.19 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  38.35 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  39.16 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  44.53 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  35.34 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  39.39 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  41.98 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  41.98 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  39.37 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  41.22 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  40.16 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  40.16 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  40.16 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  34.59 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  39.52 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  39.52 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  29.63 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  36.64 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  42.62 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  40.98 
 
 		 225 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>