More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0190 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  57.35 
 
 
1187 aa  1370    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  57.14 
 
 
759 aa  761    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  50.19 
 
 
766 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  57.27 
 
 
1187 aa  1363    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  57.33 
 
 
748 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.22 
 
 
1182 aa  1284    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  57.49 
 
 
1181 aa  1311    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  50.78 
 
 
761 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.95 
 
 
1187 aa  1360    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.54 
 
 
780 aa  817    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  57.58 
 
 
1183 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  69.73 
 
 
1215 aa  1636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.32 
 
 
794 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  56.4 
 
 
764 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  57.23 
 
 
1207 aa  1340    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  57.3 
 
 
1202 aa  1345    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  53.62 
 
 
1179 aa  1194    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  100 
 
 
1253 aa  2519    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.33 
 
 
1191 aa  1326    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  56.42 
 
 
748 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.76 
 
 
760 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.14 
 
 
795 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.14 
 
 
795 aa  787    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.19 
 
 
1187 aa  1361    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  40.57 
 
 
976 aa  612  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.52 
 
 
996 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.34 
 
 
795 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  43.49 
 
 
806 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  43.49 
 
 
806 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  39.8 
 
 
746 aa  489  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  42.1 
 
 
741 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.79 
 
 
740 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.79 
 
 
736 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  39.66 
 
 
760 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.51 
 
 
831 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.51 
 
 
731 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  53.61 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  52.45 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  37.44 
 
 
756 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.21 
 
 
432 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  37.64 
 
 
749 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  38.06 
 
 
713 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.53 
 
 
443 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.12 
 
 
754 aa  356  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.47 
 
 
753 aa  355  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.47 
 
 
753 aa  355  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  43.98 
 
 
467 aa  354  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  35.13 
 
 
757 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.33 
 
 
753 aa  353  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  46.26 
 
 
420 aa  351  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  34.82 
 
 
753 aa  351  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.57 
 
 
756 aa  350  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.09 
 
 
753 aa  348  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  42.36 
 
 
424 aa  347  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  43.69 
 
 
426 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
745 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.26 
 
 
426 aa  345  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  44.1 
 
 
432 aa  345  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.71 
 
 
425 aa  343  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.57 
 
 
432 aa  342  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  43.16 
 
 
432 aa  342  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.56 
 
 
428 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  43.09 
 
 
428 aa  337  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  43.09 
 
 
428 aa  337  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.67 
 
 
429 aa  336  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  43.98 
 
 
424 aa  333  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.27 
 
 
433 aa  331  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.96 
 
 
442 aa  317  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  36.1 
 
 
670 aa  294  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.05 
 
 
728 aa  292  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  43.78 
 
 
492 aa  292  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.6 
 
 
425 aa  288  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  43.03 
 
 
425 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.79 
 
 
425 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  43.03 
 
 
497 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40.71 
 
 
425 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40.71 
 
 
425 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.71 
 
 
425 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  42.79 
 
 
452 aa  284  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  42.79 
 
 
452 aa  284  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  42.54 
 
 
452 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  42.54 
 
 
452 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  29.48 
 
 
710 aa  282  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  42.54 
 
 
452 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  42.54 
 
 
452 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  40.75 
 
 
698 aa  281  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 
444 aa  281  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  41.15 
 
 
425 aa  280  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  41.4 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.29 
 
 
448 aa  274  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.45 
 
 
395 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.57 
 
 
441 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  42.57 
 
 
439 aa  271  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  42.97 
 
 
691 aa  271  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  42.82 
 
 
712 aa  271  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  39.62 
 
 
466 aa  270  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  42.35 
 
 
440 aa  269  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
432 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  32.6 
 
 
707 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0875  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  34.42 
 
 
698 aa  268  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.0669846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>