43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0119 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  357  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  67.08 
 
 		 179 aa  243  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  77.08 
 
 		 164 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  51.2 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  50.91 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  49.09 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  49.09 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  52.32 
 
 		 171 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  51.66 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  49.7 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  50.99 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  47.88 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  52.82 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  46.45 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  39.23 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  37.32 
 
 		 509 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  41.35 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  35.96 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  39.17 
 
 		 175 aa  97.4  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  36.26 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  39.55 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  34.46 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  33.13 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  35.51 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  32.61 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  30.12 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  34.19 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  31.69 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  27.61 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 225 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  41.27 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 225 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  50 
 
 		 225 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  34.07 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  43.9 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  45.71 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  32.08 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  30.51 
 
 		 230 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>