52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06977 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  31.21 
 
 		 312 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02883  hypothetical protein  93.94 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  30.46 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  34.13 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  34.13 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  34.13 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  34.13 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  27.52 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  28.86 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  28.86 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  28.86 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  28.86 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  28.86 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  27.4 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  41.49 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  29.09 
 
 		 340 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.64 
 
 		 304 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  27.69 
 
 		 300 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  29.33 
 
 		 319 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  29.03 
 
 		 326 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25.3 
 
 		 377 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  34.09 
 
 		 278 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  27.41 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  30.16 
 
 		 440 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  29.51 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  24.67 
 
 		 313 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  26.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  26.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  26.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  26.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  27.63 
 
 		 301 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  25.38 
 
 		 325 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  27.34 
 
 		 296 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  31.62 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  31.62 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  27.48 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  30.77 
 
 		 276 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  26.15 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  24.76 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  26.15 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  29.13 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  27.89 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  23.84 
 
 		 301 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  30.85 
 
 		 275 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  24.74 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  23.18 
 
 		 301 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  27.78 
 
 		 303 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>