112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06246 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  67.14 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  61.43 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  61.43 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  60 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  65.71 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  65.71 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  58.57 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  58.57 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  58.57 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  58.57 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  58.57 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  55.71 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  58.57 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  58.57 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  58.57 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  55.93 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  55.93 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  55.93 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198.1  putative transposase  69.05 
 
 		 43 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  39.39 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  37.88 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  39.39 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  39.39 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  39.39 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  39.39 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  36.07 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  41.54 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  36.07 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  38.46 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  38.46 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  35 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  53.12 
 
 		 56 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  35.38 
 
 		 73 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  39.44 
 
 		 99 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 94 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>