66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05928 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05928  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  66.88 
 
 		 262 aa  221  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  48.68 
 
 		 288 aa  140  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  40.28 
 
 		 272 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  39.16 
 
 		 266 aa  98.2  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  39.58 
 
 		 272 aa  97.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  34.27 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  32.17 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  32.62 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  29.75 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  29.87 
 
 		 446 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  31.97 
 
 		 411 aa  71.2  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  29.75 
 
 		 426 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  29.75 
 
 		 426 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  30.67 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  27.81 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  32.09 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  28.79 
 
 		 403 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  28.79 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  28.79 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  28.79 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  27.94 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  28.79 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 		 419 aa  61.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  31.14 
 
 		 428 aa  61.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  31.06 
 
 		 427 aa  60.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.77 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.77 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.84 
 
 		 777 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  30.07 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  30.77 
 
 		 515 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  29.79 
 
 		 424 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.77 
 
 		 780 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.09 
 
 		 790 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  26.9 
 
 		 423 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  29.63 
 
 		 441 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  28.37 
 
 		 422 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  28.37 
 
 		 425 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  28.17 
 
 		 428 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  28.17 
 
 		 428 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  28.17 
 
 		 428 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  27.66 
 
 		 428 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  28.97 
 
 		 421 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  28.14 
 
 		 414 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  26.24 
 
 		 428 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  26.24 
 
 		 428 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  31.9 
 
 		 538 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1282  diguanylate phosphodiesterase  27.48 
 
 		 294 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.080295  normal  0.395871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 422 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  25.18 
 
 		 424 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  25.18 
 
 		 422 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3335  EAL domain protein  29.84 
 
 		 540 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 424 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  27.14 
 
 		 424 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  25.9 
 
 		 544 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  26.45 
 
 		 436 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 		 424 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1374  diguanylate phosphodiesterase  25.93 
 
 		 275 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>