More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002217 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002217  manganese superoxide dismutase  100 
 
 		 202 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.378947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00151  manganese superoxide dismutase  85.07 
 
 		 202 aa  367  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2266  superoxide dismutase, Mn  77.11 
 
 		 222 aa  338  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000301489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  59.5 
 
 		 201 aa  267  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  58.71 
 
 		 205 aa  255  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  57.07 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  56.72 
 
 		 201 aa  248  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  55.84 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  56.06 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  56.1 
 
 		 204 aa  244  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  55.61 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  54 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  54.4 
 
 		 240 aa  237  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  54.37 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  55.9 
 
 		 201 aa  237  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  52.26 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  52.74 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  54.41 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  51.74 
 
 		 202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  53 
 
 		 203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  54.23 
 
 		 203 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1601  Superoxide dismutase  53.3 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  50.72 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  53.17 
 
 		 201 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  53.62 
 
 		 209 aa  228  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  52.45 
 
 		 203 aa  227  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  51.94 
 
 		 204 aa  227  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  51.94 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  53.14 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  52.45 
 
 		 203 aa  224  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  51.21 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  51.47 
 
 		 203 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  50.97 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  50.49 
 
 		 203 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  50.97 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  50.97 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  50.97 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  51.21 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  51.24 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  51.98 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  50.25 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  49.25 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  49.25 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  52.28 
 
 		 235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  49.76 
 
 		 203 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  49.03 
 
 		 203 aa  214  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  49.51 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  49.51 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  49.25 
 
 		 262 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  49.25 
 
 		 262 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  51.04 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  50.5 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  49.03 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  51.06 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  50.52 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  49.76 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  46.6 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  50.75 
 
 		 241 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  50.49 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  46.6 
 
 		 203 aa  207  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  50.5 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  50.48 
 
 		 211 aa  206  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  48.04 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  48.28 
 
 		 261 aa  206  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  51.24 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  51.01 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  50.25 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  48.78 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  50.25 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  48.74 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  48.24 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  48.79 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  50.97 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  47.57 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  47.57 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  47.57 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  47.09 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  47.57 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  47.57 
 
 		 208 aa  204  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  47.57 
 
 		 208 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  47.57 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  47.09 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  49.28 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  47.83 
 
 		 203 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  50.25 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  48.29 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  48.78 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  48.54 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  50.25 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>