More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0865 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  54.33 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  54.51 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  42.97 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  42.97 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  43.15 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  43.15 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  43.15 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  45.61 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  45.42 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  45.61 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  45.61 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  45.61 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  45.61 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  45.61 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  45.19 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  45.08 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  40 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  46.29 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  42.28 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  44.21 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  44.21 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  43.35 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  45.49 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  42.92 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  34.19 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  32.81 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  34.84 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  35.84 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  34.22 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  30.77 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  32.03 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  33.48 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  33.48 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  35.4 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  32.89 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  31.85 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  34.29 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.91 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.9 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  36.1 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.28 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  34.68 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  34.55 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  34.55 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  34.51 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  33.62 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.14 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  33.77 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  27.8 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.7 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3693  ABC transporter related  34.6 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  31.91 
 
 		 416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  33.61 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  35.02 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  36.4 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  34.71 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  34.38 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  34.08 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  34.38 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  29.69 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  34.31 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  31.2 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  29.31 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.89 
 
 		 405 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.64 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  29.51 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  34.82 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  31.56 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  27.2 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.37 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  33.78 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  30.86 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.67 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  32.37 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2076  ABC transporter related  33.33 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000611241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  36.7 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  31.6 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  27.83 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>