More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0642 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0642  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
145 aa  283  7e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  32.59 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  34.19 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  34.19 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  34.19 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  32 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  32.21 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  32.88 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  34 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  35 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  32.87 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  32.43 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  32.17 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  32.17 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  33.78 
 
 
174 aa  67  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  32.43 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  34.64 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  34.64 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  28.17 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  34.67 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  35.92 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  32.17 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  34 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  31.29 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  30 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  32.03 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  31.47 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0374  50S ribosomal protein L9  33.99 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230672  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  33.99 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  33.99 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  31.47 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  33.99 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  31.47 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  31.47 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  31.08 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0797  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000346105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  30.77 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  31.76 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  30.72 
 
 
171 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  32.17 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  30.92 
 
 
195 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  29.45 
 
 
193 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
195 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  41.75 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0423  50S ribosomal protein L9  31.87 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  32.21 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  33.54 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  30.07 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  29.45 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  28.95 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  33.11 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  35.51 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  34.46 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  26.71 
 
 
202 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  34.67 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2182  50S ribosomal protein L9  32.84 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  30.26 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  30.26 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  30.82 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  34.67 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  28.57 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  30.2 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  29.33 
 
 
190 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2413  50S ribosomal protein L9  32.09 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.209378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0005  50S ribosomal protein L9  32.09 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>