More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1414 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  69.31 
 
 		 202 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  72.84 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  56.97 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  51.98 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  50.85 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  51.41 
 
 		 189 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  53.75 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 188 aa  177  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  52.87 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  54.55 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  51.74 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  53.09 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  53.09 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  53.09 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  53.12 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  53.12 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  54.07 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  53.75 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  47.57 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  51.88 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  50.31 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  50.62 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  50.6 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  46.49 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  51.22 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  46.91 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 190 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  48.47 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  48.75 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  48.75 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  46.6 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  54.14 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  50.62 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  52.17 
 
 		 189 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  43.46 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  52.74 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  45.62 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 149 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 168 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  43.15 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.07 
 
 		 149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  45.52 
 
 		 148 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 		 150 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 150 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  48.28 
 
 		 150 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  48.28 
 
 		 150 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 149 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  41.91 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 147 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.38 
 
 		 151 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2443  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 148 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  45.52 
 
 		 150 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2820  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 148 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 149 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0756  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000105777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3583  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>