More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0195 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0195  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  2e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.10156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 88 aa  87  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  45.45 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  45.45 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  44.83 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 88 aa  84.3  6e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  47.67 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  45.35 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>