34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1706 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1706  UspA domain protein  100 
 
 
155 aa  317  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_27  Na+/H+ antiporter C-terminal domain/universal stress protein-like protein  40.44 
 
 
142 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.547805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0028  universal stress protein  40.44 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.406249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0027  UspA domain-containing protein  39.71 
 
 
142 aa  110  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  28.4 
 
 
649 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1791  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.47 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.71 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1346  hypothetical protein  26.81 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000172915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25.48 
 
 
175 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.39 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.69 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  25 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  28.21 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  25.17 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  28.08 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  25.52 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  27.54 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  30.37 
 
 
910 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  21.92 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  25 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.29 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  25 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  21.93 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  28.92 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.08 
 
 
314 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  23.9 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 
792 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.17 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  28.28 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>