More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1778 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1778  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
516 aa  1046    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1332  glycosyl transferase group 1  51.78 
 
 
509 aa  507  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.348289  normal  0.202424 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1041  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 
485 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000465616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1881  glycosyl transferase, group 1  46.11 
 
 
484 aa  405  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.897605  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1311  glycosyl transferase group 1  43.45 
 
 
483 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0361924  normal  0.410023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0971  glycosyl transferase, group 1  42.57 
 
 
484 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.397818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0344  glycosyl transferase group 1  40.95 
 
 
465 aa  376  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  27.44 
 
 
570 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4427  alpha-glucan phosphorylase  26.82 
 
 
566 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.826704  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1065  alpha-glucan phosphorylase  25.49 
 
 
559 aa  143  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00035073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  25.32 
 
 
570 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  28.71 
 
 
561 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2997  glycogen phosphorylase  26.92 
 
 
558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00491814 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0543  alpha-glucan phosphorylase  26.9 
 
 
578 aa  127  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  24.91 
 
 
541 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  27.27 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  26.44 
 
 
848 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  23.92 
 
 
541 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3640  phosphorylase  25.14 
 
 
558 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.373302  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1428  alpha-glucan phosphorylase  24.07 
 
 
834 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  23.83 
 
 
823 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  24.26 
 
 
844 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  25.04 
 
 
694 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  25.09 
 
 
863 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3890  alpha-glucan phosphorylases  25.41 
 
 
563 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  22.34 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  25.6 
 
 
854 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  23.63 
 
 
847 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  24.68 
 
 
852 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  23.86 
 
 
538 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  26.03 
 
 
863 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  23.16 
 
 
567 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  23.59 
 
 
850 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  25.36 
 
 
722 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  25.7 
 
 
854 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  25.08 
 
 
860 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  25.59 
 
 
693 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  24.62 
 
 
850 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  24.17 
 
 
875 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  23.09 
 
 
853 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  22.85 
 
 
842 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  24.26 
 
 
690 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  26.24 
 
 
858 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  23.63 
 
 
855 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  24.56 
 
 
838 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  25.14 
 
 
854 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  24.51 
 
 
853 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  25.23 
 
 
854 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  25.21 
 
 
835 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  23.98 
 
 
712 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  24.16 
 
 
736 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  24.73 
 
 
719 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0535  alpha-glucan phosphorylase  24.54 
 
 
520 aa  100  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  24.86 
 
 
854 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  24.03 
 
 
875 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  23.57 
 
 
729 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  22.79 
 
 
716 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0941  glycogen phosphorylase family protein  24.91 
 
 
833 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.893354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  21.39 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  23.54 
 
 
832 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  24.22 
 
 
873 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  24.03 
 
 
872 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  23.34 
 
 
849 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  22.61 
 
 
719 aa  97.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  22.82 
 
 
841 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0467  alpha-glucan phosphorylase  23.83 
 
 
520 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  22.82 
 
 
841 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  24.1 
 
 
704 aa  96.7  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0370  alpha-glucan phosphorylase  23.83 
 
 
520 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  28.68 
 
 
822 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  24.01 
 
 
705 aa  95.9  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  25.9 
 
 
857 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  23.26 
 
 
856 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  24 
 
 
854 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  23.71 
 
 
703 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  25.05 
 
 
860 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  23.58 
 
 
852 aa  95.1  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  24.95 
 
 
737 aa  94.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  24.17 
 
 
854 aa  94.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  25.61 
 
 
854 aa  94.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  25.05 
 
 
860 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  23.3 
 
 
855 aa  94.7  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  22.99 
 
 
854 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  25.05 
 
 
860 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1452  alpha-glucan phosphorylase  23.4 
 
 
520 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  24.32 
 
 
849 aa  94  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  22.89 
 
 
856 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  23.55 
 
 
1421 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  24.39 
 
 
852 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  25.55 
 
 
748 aa  93.6  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  22.73 
 
 
703 aa  93.6  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  23.06 
 
 
853 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  23.08 
 
 
1413 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  23.48 
 
 
881 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  24.14 
 
 
854 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  25.18 
 
 
871 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  23.82 
 
 
861 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  24.95 
 
 
863 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  23.76 
 
 
858 aa  91.3  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0308  a-glucan phosphorylase  22.47 
 
 
544 aa  90.1  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>