259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0587 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
386 aa  796    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
386 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
381 aa  423  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
374 aa  360  2e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
374 aa  359  4e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
370 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
377 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
379 aa  351  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  43.01 
 
 
484 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
424 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  37.11 
 
 
405 aa  258  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  36.48 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  36.99 
 
 
641 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
361 aa  236  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
358 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
432 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 
435 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  25.53 
 
 
422 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 
432 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
542 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
540 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
537 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  30.96 
 
 
570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
534 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  28.21 
 
 
418 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  30.38 
 
 
417 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
333 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
325 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  30.43 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  28 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
340 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.39 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.44 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.83 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.92 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  25.47 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.83 
 
 
324 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
331 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  29.65 
 
 
791 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  23 
 
 
329 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
330 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
335 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.09 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.4 
 
 
329 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.08 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  28.18 
 
 
349 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.19 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.33 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 
325 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.8 
 
 
340 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
352 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
326 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.39 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>