66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0493 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 129 aa  253  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  72.8 
 
 		 169 aa  184  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  72.8 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  72 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  67.46 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  66.13 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  56.8 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  63.64 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  73.6 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  50.41 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  52.54 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  52.54 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  53.33 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  54.62 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  50.81 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  51.67 
 
 		 120 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  51.26 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  53.39 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  51.69 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  52.59 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  51.69 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  50 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  50.42 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  47.06 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  49.15 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  49.15 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  49.15 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  45.24 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  39.82 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  41.9 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  35.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  51.19 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  37.08 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  52.38 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  49.28 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  41.67 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.48 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  47.06 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  50 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  46.38 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  48.53 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  49.25 
 
 		 266 aa  57  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.96 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  38.64 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.29 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  51.79 
 
 		 264 aa  53.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  43.48 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  43.64 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  42.35 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  44.12 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  41.33 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.51 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.51 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.58 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  38.67 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.76 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  37.21 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  33.64 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  36.25 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  40.91 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.9 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.25 
 
 		 103 aa  40  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34756  predicted protein  31.58 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.351945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>