More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2976 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 359 aa  698    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  49 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  44.03 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  43.8 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  43.19 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  40.06 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  38.4 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  39.77 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  39.77 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  37.32 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.63 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  30.46 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  33.64 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.97 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  28.84 
 
 		 384 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  31.06 
 
 		 373 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  28.91 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  34.88 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.4 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  29.18 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  42.25 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  32.49 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  28.42 
 
 		 378 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  42.25 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  38.7 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  27.87 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.5 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  28.91 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  28.86 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  30.83 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  26.92 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  27.51 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10239  predicted protein  30.68 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  31.69 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  29.35 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  38.21 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.87 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.16 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.16 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  40.64 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  30.31 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  26.32 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.38 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  31.04 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.87 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  29.95 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  30.07 
 
 		 433 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.01 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  30.36 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  25.44 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  34.41 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.29 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  29.59 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  31.09 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.29 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  28.85 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  40.64 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.44 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  28.21 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.55 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  27.55 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.77 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  28.13 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  29.72 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  29.71 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  27.55 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.77 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  25.51 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.4 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.2 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.81 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  23.68 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.02 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  30.72 
 
 		 401 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  26.01 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.71 
 
 		 345 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  25.87 
 
 		 316 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  30.1 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  30.1 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.18 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.43 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  24.18 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  23.43 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  32.57 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  32.9 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>