170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1467 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
358 aa  726    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  40.16 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.79 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.6 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.71 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  31.62 
 
 
322 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  33.6 
 
 
266 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.33 
 
 
331 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  33.05 
 
 
322 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  31.71 
 
 
353 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  30.12 
 
 
259 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  31.4 
 
 
319 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.21 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  32.67 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  29.72 
 
 
287 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.72 
 
 
285 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  37.22 
 
 
291 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.63 
 
 
293 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  28.12 
 
 
258 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  29.65 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.78 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.23 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  31.28 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  30.52 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.96 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.39 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.33 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  26.02 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.19 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.42 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.38 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  29.86 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  29.14 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.58 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  30.15 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  29.65 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  27.43 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.18 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2608  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.49 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0104915  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.04 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.59 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  27.44 
 
 
303 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.97 
 
 
310 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.41 
 
 
297 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.52 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.98 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.63 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.13 
 
 
284 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3788  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.91 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.7 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  28.89 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  29.03 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.7 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  29.02 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.78 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.7 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.97 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.56 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.34 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  29.6 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  26.46 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.77 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.77 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  28.89 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.33 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  28.76 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  28.1 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  28.63 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.64 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.3 
 
 
292 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.3 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.23 
 
 
297 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.5 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  28.63 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  27.52 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.73 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.95 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.83 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  28.63 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  28.63 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  28.63 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.18 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  30.5 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  27.4 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2351  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.91 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2343  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.91 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000921534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  27.94 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  27.53 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.4 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>