81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1602 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  80.09 
 
 
221 aa  350  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  70.59 
 
 
221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  76.02 
 
 
221 aa  310  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  51.16 
 
 
236 aa  204  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  45.07 
 
 
217 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  45.19 
 
 
224 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  42.63 
 
 
213 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  45.03 
 
 
216 aa  134  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  31.98 
 
 
233 aa  99  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  30.54 
 
 
241 aa  88.2  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  34.13 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  32.67 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  32.2 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  29.8 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  30.46 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  32.9 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  31.12 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  37.91 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  28.11 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  29.73 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  32.29 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  27.59 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  28.72 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  33.08 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  30.77 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  29.3 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  30.06 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  33.55 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  26 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  31.06 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  34.85 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  28.66 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  27.64 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  31.09 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  29.35 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  32.45 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.45 
 
 
812 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  24.71 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  28.76 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.64 
 
 
808 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  28.92 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1838  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.65 
 
 
810 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0684561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  26.49 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  26.49 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  26.49 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0212  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
802 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  26.49 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  26.49 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.86 
 
 
808 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.64 
 
 
817 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4536  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30 
 
 
807 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.140615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.78 
 
 
807 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  24.19 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.33 
 
 
797 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1306  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  34.29 
 
 
810 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.82 
 
 
807 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
795 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1930  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30 
 
 
804 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0361  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.69 
 
 
827 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3524  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.46 
 
 
800 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4271  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.46 
 
 
810 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3155  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.07 
 
 
806 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0677  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 
801 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443307  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.53 
 
 
803 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  25.5 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.06 
 
 
780 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.53 
 
 
803 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4096  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.92 
 
 
799 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0162  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.91 
 
 
824 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.676244  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.07 
 
 
808 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.27 
 
 
806 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26 
 
 
789 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1312  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.21 
 
 
803 aa  42  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.73 
 
 
793 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1284  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 
791 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1309  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.47 
 
 
799 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.32 
 
 
794 aa  41.6  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>