More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1882 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
488 aa  964    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0666  apolipoprotein N-acyltransferase  46.5 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  41.55 
 
 
487 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  41.21 
 
 
487 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  38.62 
 
 
491 aa  322  7e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  27.49 
 
 
525 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  27.82 
 
 
521 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  26.9 
 
 
542 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
477 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 
475 aa  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 
521 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  27.96 
 
 
516 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  27.97 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
507 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  27.42 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  25.74 
 
 
522 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  25.91 
 
 
506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  26.71 
 
 
529 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  28.47 
 
 
488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  24.31 
 
 
510 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
537 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  25.26 
 
 
464 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  25.59 
 
 
528 aa  126  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  26.03 
 
 
526 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  26.69 
 
 
525 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  26.85 
 
 
534 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
513 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  25.73 
 
 
535 aa  123  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  24.51 
 
 
536 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  38.64 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25.56 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  22.69 
 
 
523 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  25.79 
 
 
520 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
560 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  24.03 
 
 
522 aa  117  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  23.56 
 
 
524 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  24.74 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  25.33 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  25.19 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  25.91 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  25.54 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  27 
 
 
472 aa  113  7.000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  23.21 
 
 
524 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  26.8 
 
 
479 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 
550 aa  113  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  24.84 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0532  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
523 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  26.69 
 
 
504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  25.97 
 
 
553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  24.84 
 
 
545 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  23.9 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  23.9 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  22.81 
 
 
487 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  23.35 
 
 
512 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
511 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  23.71 
 
 
512 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  23.97 
 
 
525 aa  110  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  31.61 
 
 
537 aa  110  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  23.15 
 
 
512 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  25.32 
 
 
527 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  35.96 
 
 
760 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  27.37 
 
 
509 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  25.89 
 
 
556 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  23.31 
 
 
512 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  23.51 
 
 
512 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1405  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
516 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1374  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
516 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
576 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  24.28 
 
 
512 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  25.98 
 
 
518 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  21.69 
 
 
505 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
511 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  26.07 
 
 
488 aa  105  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  23.03 
 
 
532 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
514 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  22.77 
 
 
526 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  24.13 
 
 
508 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  24.05 
 
 
512 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.4 
 
 
553 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  23.66 
 
 
519 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  23.76 
 
 
509 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  24.35 
 
 
489 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  23.49 
 
 
514 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  22.25 
 
 
502 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  25.82 
 
 
516 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  22.81 
 
 
532 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3432  apolipoprotein N-acyltransferase  26.08 
 
 
525 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  23.75 
 
 
498 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208778  decreased coverage  0.000201014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  24.42 
 
 
509 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  27.17 
 
 
552 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  26.59 
 
 
510 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4187  apolipoprotein N-acyltransferase  31.09 
 
 
584 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
540 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  25.05 
 
 
495 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  21.96 
 
 
530 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  34.57 
 
 
537 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>