27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1724 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  766    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  19.32 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  22.1 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 442 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  19.89 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>