66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0909 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  69.57 
 
 		 730 aa  1067    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 728 aa  1492    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  65.09 
 
 		 745 aa  940    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  86.8 
 
 		 733 aa  1318    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  77.72 
 
 		 732 aa  1210    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  69.51 
 
 		 734 aa  1045    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 261 aa  128  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1073  D-lysine 5,6-aminomutase, alpha subunit  30.65 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.720029 
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  34.85 
 
 		 263 aa  124  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 261 aa  124  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  34.3 
 
 		 246 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 265 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0203  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  30.45 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.3169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  31.58 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3888  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  25.82 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0196  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  29.04 
 
 		 520 aa  112  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2663  D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  30.21 
 
 		 526 aa  110  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1906  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit, D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  27.76 
 
 		 523 aa  107  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3950  D-Lysine 56-aminomutase subunit alpha  28.66 
 
 		 525 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1084  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  27.49 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2384  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  28.4 
 
 		 520 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224895  hitchhiker  0.00032654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2265  hypothetical protein  28.09 
 
 		 520 aa  100  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00000065205  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 248 aa  94.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2384  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.42 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2472  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  26.42 
 
 		 524 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  27.57 
 
 		 255 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  27.57 
 
 		 255 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  27.94 
 
 		 251 aa  90.1  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  28.69 
 
 		 255 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2349  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  25.65 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320388  normal  0.0638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 254 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1483  beta-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit / D-lysine 5,6-aminomutase alpha subunit  26.04 
 
 		 524 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  28.16 
 
 		 255 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  27.46 
 
 		 267 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  33.64 
 
 		 210 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  30.37 
 
 		 224 aa  56.6  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  30.08 
 
 		 216 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 219 aa  54.7  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  38.3 
 
 		 149 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 219 aa  54.3  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 218 aa  53.5  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 219 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  35.35 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  33.63 
 
 		 218 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  37.23 
 
 		 149 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  33 
 
 		 144 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 222 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  30.63 
 
 		 210 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  33.03 
 
 		 213 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  37.23 
 
 		 137 aa  48.5  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  35.11 
 
 		 136 aa  47.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  30.28 
 
 		 168 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 		 216 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  30.91 
 
 		 251 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  35.45 
 
 		 210 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  30.91 
 
 		 210 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  30.91 
 
 		 210 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.63 
 
 		 607 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  28.68 
 
 		 259 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  32.29 
 
 		 139 aa  45.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  31.53 
 
 		 212 aa  44.3  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  28.95 
 
 		 804 aa  43.9  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  32.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>