More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0396 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0396  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 394 aa  796    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  34.68 
 
 		 258 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 		 253 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.43 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.92 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 		 253 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  31.58 
 
 		 257 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 		 253 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  32.43 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.29 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 		 317 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 		 256 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 		 290 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 		 290 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 		 279 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.39 
 
 		 257 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 298 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.02 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 		 253 aa  89.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.49 
 
 		 257 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.49 
 
 		 257 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  30.37 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.84 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.78 
 
 		 254 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  30.19 
 
 		 265 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  30.14 
 
 		 249 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.52 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 		 257 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  32.09 
 
 		 257 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 		 256 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 		 255 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 		 257 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  28.26 
 
 		 408 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.55 
 
 		 293 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 267 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 		 259 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 303 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  32.69 
 
 		 255 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  32.6 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 		 257 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 254 aa  86.3  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  26.92 
 
 		 314 aa  86.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 309 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  30.33 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  27.18 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 		 257 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.15 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  30.36 
 
 		 258 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 264 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.42 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  34.08 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.42 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.37 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  33.33 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  33.33 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.12 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  26.07 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  32.42 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  31.73 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.04 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  33.77 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  26.03 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  31.72 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  29.15 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  33.33 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.1 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.16 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>