26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0150 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 338 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 374 aa  195  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  22.29 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  22.98 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  20.9 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.17 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 269 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.25 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.43 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  24.75 
 
 		 263 aa  46.2  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  22.28 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  21.18 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.61 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  20.62 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>