79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1868 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  54.17 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  54.17 
 
 		 297 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  52.78 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  50.68 
 
 		 1414 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  51.35 
 
 		 297 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  50 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  50 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  48.53 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  49.3 
 
 		 287 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20840  aryl carrier domain protein  47.3 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  decreased coverage  0.00638863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  45.21 
 
 		 1167 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  45.21 
 
 		 1167 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  45.21 
 
 		 1167 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  46.58 
 
 		 1131 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  48.44 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  47.06 
 
 		 1152 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  42.25 
 
 		 1149 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  43.06 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  55.56 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.54 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  51.67 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  44 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3692  phosphopantetheine-binding protein  44.44 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  41.67 
 
 		 2174 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  35.21 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  49.23 
 
 		 1436 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  44.59 
 
 		 2350 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  43.66 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  39.13 
 
 		 1678 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  45.71 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  45.71 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  45.71 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  45.71 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  43.75 
 
 		 1174 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  38.36 
 
 		 284 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  41.67 
 
 		 293 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  53.06 
 
 		 291 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  37.14 
 
 		 2258 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3616  phosphopantetheine-binding  42.65 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  52.17 
 
 		 291 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3062  phosphopantetheine-binding  39.44 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  44 
 
 		 1501 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  44.29 
 
 		 285 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  42.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  51.56 
 
 		 1438 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  37.31 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 		 2230 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  40 
 
 		 1469 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  31.82 
 
 		 2310 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  41.33 
 
 		 1511 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  41.33 
 
 		 1489 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  46.75 
 
 		 1457 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  46.75 
 
 		 1457 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  46.75 
 
 		 1457 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  46.67 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  46.67 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  37.8 
 
 		 1463 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 		 1158 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  41.07 
 
 		 1163 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  36.92 
 
 		 2057 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  33.78 
 
 		 2200 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  39.58 
 
 		 283 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  44.9 
 
 		 2035 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  36.73 
 
 		 1497 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  38.81 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>